В магазинах продают похожие картонные наборы за пару тысяч р с обещаниями увеличения в 1000 раз.

Осталось понять из чего можно изготовить прозрачную оболочку(и чем это проще стекла).

Даже органеллы были открыты на примитивном оборудовании, у нас же задача — показать целые клетки. Луковый не подойдут, так как не чужеродны, нужно простейшее. Амёбы имеют размер до пятисот микрон, при пятидесятикратном увеличении полуачем 25 мм, почти дюйм. А теперь вспоминаем, что дюйм — это ширина большого пальца взрослого мужчины. Ну ка кто не способен разглядеть палец взрослого мужчины? Ну кроме слепых. Потом объяснить, что если не вот эта копошашаяся на стекле пакость, то ей подобная, попав внутрь другого существа, способна вызывать болезни. Инфузории бывают от 10-ти микрон до 4,5 миллиметров. То есть некоторые видны невооружённым глазом. Конкретно туфелька от ста до трёхсот микрон. При пятидесятикратном увеличении получаем от пяти до пятнадцати миллиметров, вполне видимый размер. Настоящий пятидесятикратный микроскоп сделать сможете? Постоянное, независимое от положения глаза и объекта увеличение здорово облегчит наблюдение.

Главное для попаданца — это вовсе не продвигать медицинские знания и изобретать виагру.
Главное — это продвинуть гигиену, именно она победила большинство древних болезней, а не лекарства.
То есть следует показать врачам микроорганизмы (амебы точно будут видны) и дать вводное объяснение про заражение, дальше оно покатит уже само (пусть даже и медленно).